雙頻測深儀利用其高低頻波束可達量程的不同，在測量中可根據所測水域的深度采用不同頻率的測深數據。測淤泥功能體現在聲波穿透能力不同，例如當水深小于一百米時采用高頻數據，當水深大于一百米時采用低頻數據；在河道清淤項目中也可通過高低頻的測深差值得出河道淤泥厚度。可應用于無人船等設備集成，也可配合南方的自由行8.0軟件、海洋之星軟件和無人船軟件應用于江河、湖泊、近海等水域進行精密水深測量。
雙頻測深儀整套系統全部采用測深軟件自動控制測深，智能動態信號檢測、識別和鎖定跟蹤，實時監測和控制測深全過程，保證了測深系統的高等級測深精度和可靠性。測深數據和圖像實時顯示、存儲、同步打印圖像，同時通過系統內部的數據傳輸到測量軟件，并可接分顯示器到操控臺，實現測深與導航的雙重功能,是目前國產可靠的全數字雙頻測深系統。
雙頻測深儀的高頻、低頻部分會測得不同的水深的原因是：
這是由于在水下除了水體與浮泥層之間有分界面之外，還有浮泥層與淤泥層、各個密度不同的淤泥層之間存在許多的分界面。聲波信號如果能傳遞到這些分界面上也同樣能產生回波信號。低頻聲波能穿透浮泥層及密度較小的淤泥層繼續向深處傳遞，而高頻聲波則無法穿越浮泥層，這是由于不同頻率的聲波在介質中的衰減情況不同引起。在水下測量工作中，聲波在傳遞過程中的衰減、反射等聲波的物理特性受水底底質因數影響較大。
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